一月
4日 学校成立中西医结合研究所。
7日 广州医学院知识分子联谊会正式成立。
某日 广州呼吸疾病研究所被授予“全国卫生系统先进集体”荣誉称号。
10日至21日 学校与广州金域医学检验中心、广州市妇女儿童医疗中心、广州市脑科医院、广州市第一人民医院分别联合建立的4个博士后创新实践基地正式揭牌。
二月
4日 我校主办的《胸部疾病杂志》（Journal of Thoracic Diseae）成功进入SCI。
28日 陈建华市长调研我校番禺校区规划建设情况。
四月
2日 经广州市委批准，陈杰同志任我校党委副书记、纪委书记。
11日 我校医学影像学、医学检验技术、康复治疗学、麻醉学、药学5个本科专业，获批进入广东省普通高等学校本科第一批次招生。
12日 我校呼吸疾病国家重点实验室主办的抗击非典十周年学术研讨会在广州举行。
23日 教育部正式批准我校更名为广州医科大学。
27日 广州市副市长贡儿珍到我校直属附属医院调研。
五月
7日 我校与广州金域医学检验中心合作，成立金域检验学院。
广州医科大学临床技能综合培训中心成功获批为国家大学生校外实践教育基地建设项目。
18日 我校举办广州医科大学揭牌仪式，学校发展步入新纪元。
六月
23日 我校3人入选教育部新一届高等学校教学指导委员会，其中王新华教授入选中西医结合类专业教学指导委员会委员，王家骥教授入选全科医学教学指导委员会委员，雷毅雄教授入选公共卫生与预防医学类专业教学指导委员会委员。
七月
2日 我校新增17个广东省临床重点专科。
10日 广州欧美同学会?广州留学人员联谊会广州医科大学分会正式成立。
八月
23日 经广州市卫生局批准，我校附属第五医院晋级为三级综合医院。
29日 国家科技部批准在我校附属第一医院建设“国家呼吸系统疾病临床医学研究中心”。
九月
7日 我校获得20项国家级大学生创新创业训练计划项目，实现零的突破。
21日至22日 我校举办花城教育发展论坛，海内外专家学者纵论教育国际化。
23日至27日 我校承办国家专业技术人才知识更新工程――全国社区卫生服务团队建设高级研修班。
27日 惠州市第三人民医院正式挂牌“广州医科大学附属惠州医院”，成为我校非直属附属医院。
十月
12日 中法霍夫曼免疫研究所正式揭牌。
17日 我校黄伟青老师指导、武钊等同学的作品《δ阿片受体激动剂DADLE对大鼠急性全脑缺血再灌注损伤神经凋亡及多脏器的保护作用研究》，获得第十三届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛二等奖。
23日 学校成立口腔疾病研究所。
十一月
8日 我校举行广州医科大学建校55周年庆祝大会。
某日 我校20项大学生创新创业训练计划项目入选2013年国家级大学生创新创业训练计划项目名单。
20日 我校与爱丁堡大学联合举办“2013广州-爱丁堡医学教育论坛”。
28日 继续教育学院更名为全科医学与继续教育学院
学校成立招投标中心。
十二月
10日 学校成立南山学院。
17日 举行2013年度广州医科大学“最受学生欢迎教师”颁奖典礼。
20日 我校原国家级精品课程《内科学》成功入选第三批国家级精品资源共享课立项项目。
25日 我校举行番禺新校区封顶仪式。