1月11日，广州市属首家口腔专科医院“广州医学院口腔医院”正式在羊城医院挂牌成立。

1月13日，科技部组织11名专家对学院创建国家重点呼吸疾病联合实验室进行实地考察和评估。省、市政府高度重视，副省长宋海、副市长李卓彬分别接待会见了专家组。

2月，学院内科学、老年医学、神经病学三个临床医学专业获教授任职资格评审权。

3月22日，广州医学院与英国爱丁堡大学联合主办了“动物源性及急性疾病国际研讨会”。

4月2日，广州医学院呼吸疾病实验室被科技部正式批准纳入国家重点实验室建设名单，成为国家2007年建设的27所重点实验室之一，实现了广州乃至广东省属高校国家重点实验室“零的突破”。

4月13日，广州医学院内科学（呼吸系病）被评为国家重点学科。

5月23日，广州医学院与中华医学会、广东省科技厅主办了“生物医学论坛??中国首次《Nature》专家报告会”。

6月11日，“广州医药院校校史纪念馆”和由中共中央政治局委员、广东省委书记张德江题名的“广州医学院抗击非典纪念馆”正式开放。

6月11日至15日，以中国医科大学孙宝志教授为组长、徐州医学院院长吴永平教授为副组长等9人组成的教育部专家组莅临学院，展开为期五天的全方位评估检查。

9月，广东省卫生厅批准，全省14家医院获得首批卫生部人体器官移植技术“准入证”。我院第一附属医院成为广东省唯一一家肺移植手术准入单位。

9月18日，全国道德模范评选表彰活动在北京召开，钟南山院士以其在抗击“非典”战斗中的杰出贡献当选“敬业奉献”全国道德模范。

11月9日，科技部部长万钢一行莅临学院呼吸疾病国家重点实验室指导工作。

12月，第一附属医院呼吸疾病研究所完成中南地区首例上呼吸机病人成功肺移植手术。

12月10日，广州医学院与广州军区总医院联合申报的“广东省骨科矫形技术及植入材料重点实验室”被批准为省、市共建重点实验室。

12月25日，广州医学院《机能实验学》课程被评为广东省高等学校精品课程。